Duncan Taylor a été fondée le 27 mai 1938 à Glasgow, initialement en tant que négociant en fûts et entreprise commerciale : l'entreprise achetait et commerçait des fûts de whisky, sans les embouteiller elle-même. Au fil des décennies, elle a ainsi constitué un impressionnant stock de fûts rares et anciens.
En 2001, Euan Shand, qui avait précédemment travaillé pour la distillerie Glendronach, a racheté Duncan Taylor et l'ensemble de son stock. Shand a déménagé l'entreprise à Huntly dans l'Aberdeenshire — sa ville natale — et y a construit une véritable embouteilleuse. En 2014, Duncan Taylor a de nouveau déménagé, cette fois dans un ancien supermarché rénové sur King Street à Huntly. Depuis avril 2024, Shawn Smith est le propriétaire.
Cette approche a porté ses fruits : entre 2006 et 2011, Duncan Taylor a été plusieurs fois désignée par Whisky Magazine comme "Independent Bottler of the Year". L'entreprise continue d'embouteiller selon les mêmes principes : cask strength, sans colorant et sans filtration à froid.