Im Jahr 1897 registrierte der lokale John MacDougall seine Brennerei im winzigen Hochlanddorf Tomatin — einem Ort, an dem damals einfach niemand lebte, weshalb die Brennerei von Anfang an ein eigenes Wohnviertel für ihr Personal errichtete. Nach dem Zweiten Weltkrieg wuchs Tomatin in einem beispiellosen Maßstab: 1974 zählte die Anlage 23 Brennblasen und war die größte Malzwhiskybrennerei der Welt.
Im Februar 1986 wurde Tomatin die erste schottische Brennerei, die vollständig in japanischen Besitz überging, gekauft von Takara Shuzo und Okura & Co. Seit 2002 liegt der Fokus wieder auf Single Malt anstelle von Massenproduktion für Blends, und seit 2016 positioniert sich Tomatin bewusst als 'die sanftere Seite der Highlands': leicht, sanft und fruchtig, ohne die Rauchnote vieler anderer schottischer Whiskys.